Okres Prachatice leží v jihozápadní části Jihočeského kraje. Sousedí s okresy České Budějovice, Český Krumlov, Strakonice a Klatovy. Na jihozápadě sousedí okres s Německem, na jihu s Rakouskem. Rozloha okresu je 1375 km2, žije zde přibližně 52 tisíc osob, což odpovídá hustotě osídlení 38 obyv./km2. V okrese Prachatice je celkem 65 obcí, z toho 6 má status města.
Území okresu je typickou podhorskou vrchovinou, která přechází v horské pásmo Šumavy. Nejvyšším bodem je hora Plechý s výškou 1378 m n. m., nejníže položené místo se nachází u Netolic ve výšce 410 m n. m. Vodu z území odvádí řeky Vltava a Blanice. Na Vltavě leží vodní nádrž Lipno. V jižní části okresu se rozkládá CHKO Šumava a NP Šumava. Okres Prachatice láká návštěvníky zejména k rekreaci. Nabízí čisté ovzduší, rozlehlé lesy a klid. Pro sportovní nadšence skýtá možnosti horské turistiky, vodní turistiky, cyklistiky, plavání, rybaření. Na Šumavě se nachází mnoho středisek zimních sportů. Nachází se zde i mnoho památek. Městskou památkovou rezervací je historické centrum Prachatic. Nedaleko leží Husinec, místo narození kazatele Jana Husa. Ve vimperku se nachází veřejnosti přístupný zámek, původně však gotický hrad z 13. století. Okresem prochází silnice I/4 a I/39 od hraničních přechodů s Německem a Rakouskem směrem na Prahu. Železniční síť je zde zastoupena několika regionálními tratěmi bez většího významu.
